RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 PRRG2O14669 202 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 STX7O15400 261 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPAN2O60636 221 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TPST2O60704 377 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJB6O75190 326 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 FGF19O95750 216 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV4-39P01824 125 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CCKBRP32239 447 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 RFC2P35250 354 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PCYT1AP49585 367 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 FHITP49789 147 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 FUT6P51993 359 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC61GP60059 68 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 GANABQ14697 944 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CTSL3PQ5NE16 218 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 LCE4AQ5TA78 99 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC66Q68CR7 880 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ANO5Q75V66 913 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 NLRP9Q7RTR0 991 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 GGNQ86UU5 652 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM123Q8N131 208 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ASB5Q8WWX0 329 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MYLPFQ96A32 169 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MCUR1Q96AQ8 359 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ZG16BQ96DA0 208 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 C20orf173Q96LM9 149 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 LPAR4Q99677 370 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF747Q9BV97 191 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB18Q9NP72 206 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MED17Q9NVC6 651 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 EMCNQ9ULC0 261 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNMO15061 1565 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM5CP41229 1560 aa4.14□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM135BQ49AJ0 1406 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A087WZ39 114 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GTQ1 180 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ASPDHA6ND91 283 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SHISA7A6NL88 538 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TCP10L2B9ZVM9 353 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 BTN3A3O00478 584 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ANXA9O76027 345 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PAHP00439 452 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CALCAP01258 141 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PRSS2P07478 247 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXC6P09630 235 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 LAP3P28838 519 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEA8P43361 318 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CCT3P49368 545 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 AP3M2P53677 418 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PLA2G16P53816 162 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SPAG1Q07617 926 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 DOC2AQ14183 400 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM44Q2T9K0 475 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATS1Q496A3 300 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ATL3Q6DD88 541 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 DOK6Q6PKX4 331 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF562Q6V9R5 426 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 Q7L0L9 218 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CENPSQ8N2Z9 138 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNG3Q8TAE7 436 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 NANPQ8TBE9 248 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PNPLA2Q96AD5 504 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 RIT2Q99578 217 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CITED1Q99966 193 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 DCTPP1Q9H773 170 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC2A8Q9NY64 477 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR83Q9NYM4 423 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 NLGN3Q9NZ94 848 aa4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms