RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	ERP27	Q96DN0	273 aa		16.21	■□□□□ 0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	OMA1	Q96E52	524 aa		16.21	■□□□□ 0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	16.21	■□□□□ 0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	PRODH2	Q9UF12	536 aa		16.21	■□□□□ 0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		16.21	■□□□□ 0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC151	A5D8V7	595 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CDH16	O75309	829 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CTAG2	O75638	210 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PROC	P04070	461 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT15	P19012	456 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	DRD5	P21918	477 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIC	P45877	212 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	GSTM5	P46439	218 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPC1	P48995	793 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	NAA20	P61599	178 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP2R2A	P63151	447 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	DESI1	Q6ICB0	168 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	LIX1	Q8N485	282 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	GNRHR2	Q96P88	292 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	NODAL	Q96S42	347 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PPCS	Q9HAB8	311 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	EHD3	Q9NZN3	535 aa		16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	16.2	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	MED12	Q93074	2177 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	FRG2C	A6NGY1	282 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BQF6	201 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PLIN3	O60664	434 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	MYL2	P10916	166 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPN6	P29350	595 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	MASP1	P48740	699 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	DLX5	P56178	289 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJB13	P59910	316 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SNTA1	Q13424	505 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC153	Q494R4	210 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	BTBD9	Q96Q07	612 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMP4	Q99727	224 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	EBPL	Q9BY08	206 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	16.19	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	AHRR	A9YTQ3	701 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	UGT2B11	O75310	529 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CRHR1	P34998	444 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	NAGLU	P54802	743 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	VASN	Q6EMK4	673 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	VSTM2L	Q96N03	204 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		16.18	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	DNHD1	Q96M86	4753 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	GNB5	O14775	395 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SNPH	O15079	494 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PLOD3	O60568	738 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ICOSLG	O75144	302 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAPPC6A	O75865	159 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	EPPIN	O95925	133 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CT45A8	P0DMV1	189 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CT45A9	P0DMV2	189 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	DDC	P20711	480 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SLCO1A2	P46721	670 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CCT5	P48643	541 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	BTK	Q06187	659 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		16.17	■□□□□ 0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		16.17	■□□□□ 0.18

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