RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COX6B1P14854 86 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAPK1P28482 360 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPC1P35052 558 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CASP3P42574 277 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CEBPEQ15744 281 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BICRALQ6AI39 1079 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ASB5Q8WWX0 329 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MARVELD3Q96A59 401 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCT7Q99832 543 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM114B3SHH9 223 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDPK1O15530 556 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR1O75083 606 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FGF4P08620 206 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GABRA1P14867 456 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACVR2AP27037 513 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MC3RP41968 323 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRPC1P48995 793 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF844Q08AG5 666 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DUSP8Q13202 625 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EFR3AQ14156 821 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM107Q6UX40 140 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR7G2Q8NG99 324 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMBIM1Q969X1 311 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPCDCQ96CD2 204 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL21A1Q96P44 957 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TSSK3Q96PN8 268 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BTBD9Q96Q07 612 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PROK2Q9HC23 129 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.88□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A087WV62 115 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAM10O14672 748 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GNB5O14775 395 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIP5K1BO14986 540 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TO15178 435 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSPA4LO95757 839 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BPGMP07738 259 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHRNB4P30926 498 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ASMTP46597 345 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PMPCAQ10713 525 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SNTA1Q13424 505 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADOQ96SZ5 270 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 REEP4Q9H6H4 257 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB21Q9UL25 225 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.87□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM233B4DJY2 109 aa14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AKAP10O43572 662 aa14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TYROBPO43914 113 aa14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UGT2B11O75310 529 aa14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CREB1P16220 341 aa14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SDC1P18827 310 aa14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TACR1P25103 407 aa14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HPCAL1P37235 193 aa14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CORO7P57737 925 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms