RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428082.6

TVP23C-203, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-203ENST00000428082 YKT6O15498 198 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 KDM1AO60341 852 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 MFN2O95140 757 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 BCHEP06276 602 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 OSMP13725 252 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PSMB5P28074 263 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 FASLGP48023 281 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ZNF45Q02386 682 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 DCST1Q5T197 706 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 BTBD2Q9BX70 525 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 UCK2Q9BZX2 261 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.76□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 LNP1A1A4G5 178 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 NDUFS4O43181 175 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 CLEC3AO75596 197 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 GASTP01350 101 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 MYF5P13349 255 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 CHMP24386 653 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 GADD45AP24522 165 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PPP2R1BP30154 601 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SOX6P35712 828 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 RGS6P49758 472 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ILKQ13418 452 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 GNA13Q14344 377 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 DUSP7Q16829 419 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PERM1Q5SV97 790 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 KRT73Q86Y46 540 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 TMEM19Q96HH6 336 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 F2RL3Q96RI0 385 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 EHD3Q9NZN3 535 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.75□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 BTN3A3O00478 584 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 GUCY1B2O75343 617 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 NUDT6P53370 316 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 UGT2B15P54855 530 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SP140LQ9H930 580 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 AMBNQ9NP70 447 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 AGAP5A6NIR3 686 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 POU2F1P14859 743 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 TGM1P22735 817 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 KCNJ5P48544 419 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ARFIP1P53367 373 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 NDUFA9Q16795 377 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 AVL9Q8NBF6 648 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 OR4C6Q8NH72 309 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 NEURL2Q9BR09 285 aa14.74□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 IFT52Q9Y366 437 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms