RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIN2CQ14957 1233 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ANGPT1Q15389 498 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ACSM5Q6NUN0 579 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGN2P46Q86SG4 172 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFP41Q8N8Y5 198 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 FGF11Q92914 225 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TCEAL4Q96EI5 215 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 IL17FQ96PD4 163 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 WACQ9BTA9 647 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 AUP1Q9Y679 476 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 M0R3H8 397 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGN4O00479 90 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SOD1P00441 154 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PDGFAP04085 211 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 WEE1P30291 646 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CTBP2P56545 445 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM205BPQ63HN1 556 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM215Q68D42 235 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 OLIG3Q7RTU3 272 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 GHDCQ8N2G8 530 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC20Q8TCA0 184 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC120Q96HB5 630 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF354BQ96LW1 612 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC14L3Q9UDX4 400 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF11Q9UIL8 331 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 WASH3PC4AMC7 463 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PLPP1O14494 284 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SCO1O75880 301 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP11P24347 488 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNJ5P48544 419 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PODNL1Q6PEZ8 512 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 IKBIPQ70UQ0 350 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 C6orf120Q7Z4R8 191 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ADIPOR2Q86V24 386 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXL6Q8N531 539 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF366Q8N895 744 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 OR9A1PQ8NGU1 263 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 RNFT2Q96EX2 444 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 NRTNQ99748 197 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 GPA33Q99795 319 aa17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ADH1AP07327 375 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ELFN1P0C7U0 828 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ACP2P11117 423 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 DDCP20711 480 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 XPAP23025 273 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CD79BP40259 229 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 BTG1P62324 171 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 EFNB1P98172 346 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC32Q14392 662 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 FCN2Q15485 313 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SPDYE7PQ495Y7 208 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX261Q6UWH6 196 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZER1Q7Z7L7 766 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC9B2Q86UD5 537 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC51BQ86UW2 128 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 C12orf10Q9HB07 376 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CTPS2Q9NRF8 586 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MAFFQ9ULX9 164 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PLAGL1Q9UM63 463 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 A4GNTQ9UNA3 340 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 U3KQ87 197 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0A6YYJ9 748 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 BTN3A3O00478 584 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CHP2O43745 196 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 HK1P19367 917 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 GIPRP48546 466 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LBX1P52954 281 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB40BQ12829 278 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SYPL1Q16563 259 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 DUSP6Q16828 381 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SZRD1Q7Z422 152 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OR2AG1Q9H205 316 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SERHL2Q9H4I8 314 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 FOLH1BQ9HBA9 442 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ACAD8Q9UKU7 415 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 INSL6Q9Y581 213 aa17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PDPK1O15530 556 aa17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms