RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366517.5

SMYD3-202, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMYD3, Length 1,372 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-202ENST00000366517 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.86□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 TGP01266 2768 aa6.86□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 B9A039 149 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 HS6ST1O60243 411 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 HCN1O60741 890 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 WDR1O75083 606 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 DNAJB6O75190 326 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 OR2J2O76002 312 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 GOSR1O95249 250 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 IFNA16P05015 189 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 GABRA1P14867 456 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 STMN1P16949 149 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 CNR1P21554 472 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 SAT1P21673 171 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 SERPINF1P36955 418 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 HNF4AP41235 474 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PAFAH1B1P43034 410 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 MAN2A2P49641 1150 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 MAP2K6P52564 334 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 LIM2P55344 173 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 TAS2R39P59534 338 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 STX4Q12846 297 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 BMPR2Q13873 1038 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 RUNX2Q13950 521 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 KEAP1Q14145 624 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PDK4Q16654 411 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 OGFOD2Q6N063 350 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 MDGA2Q7Z553 956 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 CDC20BQ86Y33 519 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PDPRQ8NCN5 879 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 MAP6Q96JE9 813 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 RASL10BQ96S79 203 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 GPR22Q99680 433 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 CPNE1Q99829 537 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 AICDAQ9GZX7 198 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 WWOXQ9NZC7 414 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PSAT1Q9Y617 370 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 NOTCH1P46531 2555 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 TMEM82A0PJX8 343 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 C4orf51C9J302 202 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 TP73O15350 636 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 BANF1O75531 89 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 OR6B1O95007 311 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 P04436 131 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 ACVR2AP27037 513 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 GP5P40197 560 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 GDF5P43026 501 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PLA2G16P53816 162 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 HSF1Q00613 529 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PLGLB1Q02325 96 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 CALCOCO2Q13137 446 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 NAB1Q13506 487 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 EFR3AQ14156 821 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.311e-7■□□□□ 11.1
SMYD3-202ENST00000366517 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 GXYLT1Q4G148 440 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 XKR6Q5GH73 641 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 LAS2Q8IYD9 372 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 FAM47BQ8NA70 645 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 TSPEARQ8WU66 669 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 TANKQ92844 425 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 SARAFQ96BY9 339 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 DIRC2Q96SL1 478 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-202ENST00000366517 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms