RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 TAP2Q03519 686 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RAB40BQ12829 278 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ZIC5Q96T25 663 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RDH8Q9NYR8 311 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 LIPT1Q9Y234 373 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ETHE1O95571 254 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 F11P03951 625 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 SPNP16150 400 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ALAS2P22557 587 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 M0R082 166 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 FLRT2O43155 660 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 LATO43561 262 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 SLCO2B1O94956 709 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RASGRP1O95267 797 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF385BQ569K4 471 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 MLIPQ5VWP3 458 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 C10orf111Q8N326 155 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 XCR1P46094 333 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 CAPNS2Q96L46 248 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 PRKYO43930 277 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 CTSEP14091 401 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 DNASE1P24855 282 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 SAMD8Q96LT4 415 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0G2JPF8 293 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 LRRN3E7EW58 273 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 MBTPS1Q14703 1052 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 SYT14Q8NB59 555 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 OR56A3Q8NH54 315 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 CHFRQ96EP1 664 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 GNG8Q9UK08 70 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 C1orf226A1L170 272 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 FAM183AA6NL82 134 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 GMFGO60234 142 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ACTR1BP42025 376 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ACTR1AP61163 376 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF613Q6PF04 617 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 NUDT15Q9NV35 164 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 NCR1O76036 304 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 NPPBP16860 134 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 HOXA9P31269 272 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 TAS2R43P59537 309 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 PON3Q15166 354 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 GAREM2Q75VX8 874 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 MOAP1Q96BY2 351 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 PRRC1Q96M27 445 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms