RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 BORAQ6PGQ7 559 aa15.19■□□□□ 0.02
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HPS1-202ENST00000338546 FAM181AQ8N9Y4 354 aa15.19■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.19■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.19■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 FEVQ99581 238 aa15.19■□□□□ 0.02
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HPS1-202ENST00000338546 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
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HPS1-202ENST00000338546 ZNF566Q969W8 418 aa15.19■□□□□ 0.02
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HPS1-202ENST00000338546 ARHGDIGQ99819 225 aa15.19■□□□□ 0.02
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HPS1-202ENST00000338546 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.19■□□□□ 0.02
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HPS1-202ENST00000338546 GCGRP47871 477 aa15.17■□□□□ 0.02
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HPS1-202ENST00000338546 CD47Q08722 323 aa15.17■□□□□ 0.02
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HPS1-202ENST00000338546 GALNT12Q8IXK2 581 aa15.17■□□□□ 0.02
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HPS1-202ENST00000338546 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR52J3Q8NH60 311 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CDS1Q92903 461 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 PEX11GQ96HA9 241 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 PRRC1Q96M27 445 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR1F2PQ96R84 312 aa15.17■□□□□ 0.02
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