RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 BNIP2Q12982 314 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 TP53BP2Q13625 1128 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 CEACAM7Q14002 265 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 VEZF1Q14119 521 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 SELPLGQ14242 412 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 ASB9Q96DX5 294 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 AK1P00568 194 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 KCNJ2P63252 427 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 EXT1Q16394 746 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 MTX3Q5HYI7 312 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 LANCL3Q6ZV70 420 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC80Q76M96 950 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-202ENST00000317118 PTOV1Q86YD1 416 aa5.48□□□□□ -1.53
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