RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 OR10G2Q8NGC3 310 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 THAP11Q96EK4 314 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNC2Q96PR1 638 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PIP5K1AQ99755 562 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP3K3Q99759 626 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 DGCR6LQ9BY27 220 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 C5orf58C9J3I9 102 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 J3KTA2 159 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 B4GALT2O60909 372 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 INMTO95050 263 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SSR2P43308 183 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 XCR1P46094 333 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 STT3AP46977 705 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ABATP80404 500 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 DUSP7Q16829 419 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RASSF1Q9NS23 344 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ACER3Q9NUN7 267 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PSME2Q9UL46 239 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 C2orf74A8MZ97 194 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 STATHP02808 62 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TFPTP0C1Z6 253 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CCKBRP32239 447 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 HMGA2P52926 109 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 NFATC3Q12968 1075 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MLC1Q15049 377 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 LGI4Q8N135 537 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 FAR1Q8WVX9 515 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CSF3RQ99062 836 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 STRADBQ9C0K7 418 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB33BQ9H082 229 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RLIMQ9NVW2 624 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 HAT1O14929 419 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM20BO75063 409 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 BCHEP06276 602 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RHCEP18577 417 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CDH3P22223 829 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 HYAL2Q12891 473 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2L3Q8NG85 312 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB8BQ92930 207 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 FKBP10Q96AY3 582 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SATB2Q9UPW6 733 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 KNTC1P50748 2209 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SH3PXD2BA1X283 911 aa14.85□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.85□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 A8MVJ9 347 aa14.85□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 HMGN4O00479 90 aa14.85□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDH17O14917 1159 aa14.85□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SERPINB7O75635 380 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms