RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR34Q96EX3 536 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGQQ9BRB3 760 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PINK1Q9BXM7 581 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF122Q9H9V4 155 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf21Q9HAI6 301 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 USF3Q68DE3 2245 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM234BA2RU67 622 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SSX4O60224 188 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 CGAP01215 116 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 FGGP02679 453 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 F7P08709 466 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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PGGT1B-201ENST00000296642 IL32P24001 234 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SSTR4P31391 388 aa7.08□□□□□ -1.28
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PGGT1B-201ENST00000296642 CHIT1Q13231 466 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SCGB2A2Q13296 93 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PON3Q15166 354 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB35Q15286 201 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 TGFBIQ15582 683 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 RAET1LQ5VY80 246 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT13Q86X67 352 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 MED12LQ86YW9 2145 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR22Q8IZ63 422 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4K14Q8NGD5 310 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PROX1Q92786 737 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.08□□□□□ -1.28
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PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 CERS2Q96G23 380 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 RADILQ96JH8 1075 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 WHRNQ9P202 907 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 BCAP29Q9UHQ4 241 aa7.08□□□□□ -1.28
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PGGT1B-201ENST00000296642 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC14L5O43304 696 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0513O60268 411 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 REM1O75628 298 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNGR4O95473 234 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PLAUP00749 431 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV4-39P01824 125 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SOD3P08294 240 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 DANCRP0C864 163 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 IL11P20809 199 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 GPX3P22352 226 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 IL12BP29460 328 aa7.07□□□□□ -1.28
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PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3CBP42338 1070 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V0D1P61421 351 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGCS1Q01581 520 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP1B1Q16678 543 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PDSS1Q5T2R2 415 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 C18orf63Q68DL7 685 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 GPSM1Q86YR5 675 aa7.07□□□□□ -1.28
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