RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285689.7

GRAMD2B-201, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD2B, Length 3,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-201ENST00000285689 MVDP53602 400 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 DEF8Q6ZN54 512 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 HSD17B8Q92506 261 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 PTP4A1Q93096 173 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 QSOX1O00391 747 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 HCN1O60741 890 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SOAT1P35610 550 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 UFD1Q92890 307 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 DPH7Q9BTV6 452 aa14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 GPR171O14626 319 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ZP3P21754 424 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 HLA-FP30511 346 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 LCN1P31025 176 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 NFATC2Q13469 925 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 BICRALQ6AI39 1079 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SYT9Q86SS6 491 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 LRR1Q96L50 414 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 NRTNQ99748 197 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ARL15Q9NXU5 204 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 PRKYO43930 277 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 IL1AP01583 271 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SOD2P04179 222 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 F8A1P23610 371 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 BLVRAP53004 296 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 CERS4Q9HA82 394 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 HIDE1A8MVS5 230 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 PRSS44E7EML9 344 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ARPC5O15511 151 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 LRG1P02750 347 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 C8AP07357 584 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 CCL5P13501 91 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 MAPK1P28482 360 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 HAAOP46952 286 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 METAP1P53582 386 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ELP2Q6IA86 826 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SERPINA11Q86U17 422 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 DLL4Q9NR61 685 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ACER3Q9NUN7 267 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.75□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SCAMP1O15126 338 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 MID1O15344 667 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ZNF254O75437 659 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SPDEFO95238 335 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 OR10A3P58181 314 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 PPP3R1P63098 170 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 IFI44LQ53G44 452 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 TCTE1Q5JU00 501 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 HSDL2Q6YN16 418 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 OR7G3Q8NG95 312 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 WDR48Q8TAF3 677 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 PLD4Q96BZ4 506 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 ATF6BQ99941 703 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 REG4Q9BYZ8 158 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SPTBP11277 2137 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 TMEM202A6NGA9 273 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 L7N2F9 121 aa14.74□□□□□ -0.05
GRAMD2B-201ENST00000285689 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms