RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ACADLP28330 430 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PTPN6P29350 595 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MGAT3Q09327 533 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SETD6Q8TBK2 473 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TESCQ96BS2 214 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NUS1Q96E22 293 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 DEFB118Q96PH6 123 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 DPH1Q9BZG8 443 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.89□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZNF432O94892 652 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ALX3O95076 343 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CAP1Q01518 475 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 FGL2Q14314 439 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 RAB12Q6IQ22 244 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 KCTD9Q7L273 389 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 FKBP10Q96AY3 582 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 DOK1Q99704 481 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GON7Q9BXV9 100 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ADH1AP07327 375 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NPIPA8P0DM63 369 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 LNX2Q8N448 690 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OSTF1Q92882 214 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 M0R082 166 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 UPK1AO00322 258 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 LRRTM2O43300 516 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ARL6IP5O75915 188 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 BMP8BP34820 402 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PNLIPRP1P54315 467 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TP53I3Q53FA7 332 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 LACC1Q8IV20 430 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ASB11Q8WXH4 323 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MED31Q9Y3C7 131 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 C1QCP02747 245 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 LIPCP11150 499 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 IDSP22304 550 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CLDN12P56749 244 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NDUFA9Q16795 377 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PAQR7Q86WK9 346 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OR4K13Q8NH42 304 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 THEM6Q8WUY1 208 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 C7orf34Q96L11 122 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CD93Q9NPY3 652 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZNF3P17036 446 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CCR6P51684 374 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 DPP7Q9UHL4 492 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 H7C2Y5 167 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GKN3PP0CG01 181 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PON3Q15166 354 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SPERTQ8NA61 448 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TRIB2Q92519 343 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SOCS5O75159 536 aa14.87□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms