RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 TIAF1O95411 115 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 GNAO1P09471 354 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 HSD17B7P56937 341 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 CHRNEQ04844 493 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 STX4Q12846 297 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PDK3Q15120 406 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 MED25Q71SY5 747 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC9A6Q92581 669 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 LOXL4Q96JB6 756 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM210AQ96ND0 272 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NDC1Q9BTX1 674 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM247A6NEH6 219 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN4O14493 209 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10H2O60403 315 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 E2F6O75461 281 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE9AO76083 593 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PDX1P52945 283 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 DAB2P98082 770 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 GPAT3Q53EU6 434 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 CARM1Q86X55 608 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 BBS10Q8TAM1 723 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 CNBD2Q96M20 576 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF607Q96SK3 696 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ADI1Q9BV57 179 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0G2JPF8 293 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 A8MVJ9 347 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 FFAR1O14842 300 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 DSCR3O14972 297 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PFDN1O60925 122 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 RRM2P31350 389 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 MERTKQ12866 999 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 DSG2Q14126 1118 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC36A3Q495N2 470 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf189Q5VU69 101 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 MLIPQ5VWP3 458 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 LACC1Q8IV20 430 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 RIT1Q92963 219 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6C1Q96RD1 312 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 BTBD2Q9BX70 525 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 USE1Q9NZ43 259 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 BAG5Q9UL15 447 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPT1Q9Y234 373 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GX78 115 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DUXAA6NLW8 204 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 BMP10O95393 424 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SSTR4P31391 388 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 STT3AP46977 705 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 EMDP50402 254 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF605Q86T29 641 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF354BQ96LW1 612 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PIGUQ9H490 435 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF304Q9HCX3 659 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 A6NHS1 94 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINB7O75635 380 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CLIC3O95833 236 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF883P0CG24 379 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms