RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM185BQ9H7F4 350 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 SFTPBP07988 381 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FBLP22087 321 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CST6Q15828 149 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM205Q6UW68 189 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CD300LFQ8TDQ1 290 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 M0R129 80 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 WNT4P56705 351 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ACTBP60709 375 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ACTG1P63261 375 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 APOFQ13790 326 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF709Q8N972 641 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 NLKQ9UBE8 527 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FOXA1P55317 472 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 FAM46BQ96A09 425 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 TREX1Q9NSU2 369 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-201ENST00000284617 CGB2Q6NT52 195 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 BEST3Q8N1M1 668 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ANKK1Q8NFD2 765 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 LDAHQ9H6V9 325 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ENY2Q9NPA8 101 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TOXO94900 526 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN2CP42773 168 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 LCKP06239 509 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ADRB3P13945 408 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 IL4RP24394 825 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ5P48544 419 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ARF1P84077 181 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 EFR3AQ14156 821 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ASB4Q9Y574 426 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 FMO6PO60774 539 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 IL33O95760 270 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GNRHRP30968 328 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 LRP8Q14114 963 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf33Q6P1S2 294 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MSANTD3Q96H12 275 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PGAM5Q96HS1 289 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 VAPAQ9P0L0 249 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 RGS19P49795 217 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 IER5LQ5T953 404 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SYT14Q8NB59 555 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NRG4Q8WWG1 115 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ASB12Q8WXK4 309 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TMIGD2Q96BF3 282 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NTMT1Q9BV86 223 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SYNGR4O95473 234 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ENPP5Q9UJA9 477 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 LRP6O75581 1613 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SDC1P18827 310 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 AMY2BP19961 511 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SLC14A2Q15849 920 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 RAB11BQ15907 218 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM25Q86YD3 366 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 OR5L2Q8NGL0 311 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 OR4K13Q8NH42 304 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 FBRSQ9HAH7 460 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 EMCNQ9ULC0 261 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MEN1O00255 615 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DUX1O43812 170 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 RORAP35398 523 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms