RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259607.6

CCL21-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 21, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL21, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21-201ENST00000259607 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.49□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.49□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.49□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.49□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 TENM4Q6N022 2769 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 A0A1W2PRB8 838 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 A0A1W2PS29 197 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 OR14I1A6ND48 311 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 NPIPA5E9PKD4 350 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 PRRG2O14669 202 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 EMC8O43402 210 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 LRATO95237 230 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 CLPSP04118 112 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 STSP08842 583 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 IDO1P14902 403 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 ABOP16442 354 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 LCN1P31025 176 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 MC3RP41968 323 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 MASP1P48740 699 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 TDGF1P3P51864 188 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 PNLIPRP2P54317 469 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 HSPB3Q12988 150 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 TP53BP2Q13625 1128 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 LTB4RQ15722 352 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 C4orf17Q53FE4 359 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 TMEM64Q6YI46 380 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 ZNF227Q86WZ6 799 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 OR10G3Q8NGC4 313 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 ARL8AQ96BM9 186 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 COQ8BQ96D53 544 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 OMA1Q96E52 524 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 EGLN2Q96KS0 407 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 C3orf30Q96M34 536 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 VSTM2LQ96N03 204 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 C7orf26Q96N11 449 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 C1orf50Q9BV19 199 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 HES7Q9BYE0 225 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 NUF2Q9BZD4 464 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 FOLH1BQ9HBA9 442 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 MRGBPQ9NV56 204 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 NPIPA1Q9UND3 350 aa9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 DUXAA6NLW8 204 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 CFLARO15519 480 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 ATP8B1O43520 1251 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SUSD5O60279 629 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 HCN1O60741 890 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SLC19A2O60779 497 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 REM1O75628 298 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 AGR2O95994 175 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 CCL3P10147 92 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 G6PDP11413 515 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 ARRB2P32121 409 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 PTGS2P35354 604 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 KIR3DL1P43629 444 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 GPR85P60893 370 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 PMP22Q01453 160 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 OCRLQ01968 901 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 PTGR1Q14914 329 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SLC10A1Q14973 349 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 GSTA3Q16772 222 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 ACAD11Q709F0 780 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SZRD1Q7Z422 152 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SIAH3Q8IW03 269 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 NUP43Q8NFH3 380 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 OR7G2Q8NG99 324 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SFXN5Q8TD22 340 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 TESCQ96BS2 214 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SLC35A4Q96G79 324 aa9.47□□□□□ -0.89
CCL21-201ENST00000259607 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms