RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa17.01■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 KRT73Q86Y46 540 aa17.01■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 BBS10Q8TAM1 723 aa17.01■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 RASSF5Q8WWW0 418 aa17.01■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 TWSG1Q9GZX9 223 aa17.01■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 GIMAP4Q9NUV9 329 aa17.01■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 IMPAD1Q9NX62 359 aa17.01■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 ACAD8Q9UKU7 415 aa17.01■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 ZNF860A6NHJ4 632 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 ZAR1LA6NP61 321 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 EMC8O43402 210 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PPP1CAP62136 330 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PRR5P85299 388 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 RUNX2Q13950 521 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 LYSMD4Q5XG99 296 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 BHLHB9Q6PI77 547 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 FAM111BQ6SJ93 734 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PRSS41Q7RTY9 318 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 OR6T1Q8NGN1 323 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 SLC7A13Q8TCU3 470 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 COL26A1Q96A83 441 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 ZG16BQ96DA0 208 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 BCL2L10Q9HD36 194 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 GPR27Q9NS67 375 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 KCMF1Q9P0J7 381 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 ANKMY1Q9P2S6 941 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 REV1Q9UBZ9 1251 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PILRAQ9UKJ1 303 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 CLCA1A8K7I4 914 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 TNFSF14O43557 240 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 CPN2P22792 545 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 CNR2P34972 360 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 TNFRSF17Q02223 184 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 DEPDC4Q8N2C3 294 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 NDNFQ8TB73 568 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 DOK4Q8TEW6 326 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 DNASE2BQ8WZ79 361 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 GIMAP5Q96F15 307 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 FUZQ9BT04 418 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PRR14Q9BWN1 585 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PCED1AQ9H1Q7 454 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 FKBP14Q9NWM8 211 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 CPNE7Q9UBL6 633 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 FBXO4Q9UKT5 387 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 DSPPQ9NZW4 1301 aa17■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 A0A1B0GVT2 93 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 TLR4O00206 839 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 SDC3O75056 442 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 UGT2B17O75795 530 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 ADAP00813 363 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 TNFP01375 233 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 INHBBP09529 407 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 SMIM10L1P0DMW3 83 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PI4KAP42356 2102 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 MAN2A2P49641 1150 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 RAB15P59190 212 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 ANKDD1AQ495B1 522 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 OR7G2Q8NG99 324 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PIGKQ92643 395 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 SMIM10Q96HG1 83 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 UCK2Q9BZX2 261 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 TBCCD1Q9NVR7 557 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 R4GN57 208 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 FAAHO00519 579 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 CDK1P06493 297 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 STSP08842 583 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 TGFBR2P37173 567 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 VBP1P61758 197 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 CSNK2BP67870 215 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 ID2Q02363 134 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 CHRNEQ04844 493 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 MLIPQ5VWP3 458 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 MOAP1Q96BY2 351 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 SCN2AQ99250 2005 aa16.98■□□□□ 0.31
USP18-201ENST00000215794 TMEM131Q92545 1883 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.8 ms