RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046206.3

Rprd1a-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1a, Length 4,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 CcniQ9Z2V9 377 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Zfp978A2A7I1 335 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Pramef6A2A8M8 474 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Zfp981A2A8V7 445 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm14295A2BG91 834 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Zfp945E9PYM8 794 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Olfr738L7N1X7 311 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm5724L7N264 670 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cx3cl1O35188 395 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Nr4a1P12813 601 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 VaspP70460 375 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 TigitP86176 249 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Csn1s2aQ02862 184 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Akt2Q60823 481 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Commd2Q8BXC6 199 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Laptm4bQ91XQ6 227 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Qrsl1Q9CZN8 525 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Brca1P48754 1812 aa14.65□□□□□ -0.06
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ascc3E9PZJ8 2198 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Igkv12-98A0A0G2JGF9 115 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ndor1A2AI05 598 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Amd2D3Z6H8 334 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm2956E9PVJ0 216 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Mid1O70583 680 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Amd1P0DMN7 334 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 AbatP61922 500 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Art5P70352 309 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 P2rx3Q3UR32 397 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Mylk4Q5SUV5 386 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Xrcc1Q60596 631 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Prap1Q80XD8 149 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Prr11Q8BHE0 368 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Olfr692Q8VF03 329 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Olfr649Q8VGW1 312 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 TpbpbQ9CQC0 121 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Slco6d1Q9D5W6 683 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ptdss2Q9Z1X2 473 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ntf3P20181 258 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Timm8a2Q4FZG7 97 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Znf182Q6P560 627 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cdkl1Q8CEQ0 352 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Pafah2Q8VDG7 390 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Rpe65Q91ZQ5 533 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Spred2Q924S7 410 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Timm22Q9CQ85 194 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Tmem8aQ9ESN3 769 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 B4galt2Q9Z2Y2 369 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ccdc166S4R181 449 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 BC025446A0A087WQT1 134 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2abC0HKE1 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2acC0HKE2 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2adC0HKE3 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2aeC0HKE4 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2agC0HKE5 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2aiC0HKE6 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2anC0HKE7 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2aoC0HKE8 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2apC0HKE9 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Prss56F2YMG0 604 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Vmn1r168K7N6B6 309 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Clk4O35493 481 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 ComtO88587 265 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 EvlP70429 414 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 InhaQ04997 366 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Tmem38aQ3TMP8 298 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 NnatQ61979 81 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist3h2aQ8BFU2 130 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Dcaf12l2Q8BGW4 469 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 CptpQ8BS40 216 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Kcnmb1Q8CAE3 191 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 EfhbQ8CDU5 853 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2afQ8CGP5 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2ahQ8CGP6 128 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hist1h2akQ8CGP7 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cables2Q8K3M5 476 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 H2afjQ8R1M2 129 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 NpntQ91V88 561 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Slc15a4Q91W98 574 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Mrgpra1Q91WW5 304 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 NaxdQ9CZ42 343 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gtf2e2Q9D902 292 aa14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm266A6H634 200 aa14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 ItpkbB2RXC2 942 aa14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Xkr6E9Q6C8 638 aa14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Olfr629Q0VBH3 314 aa14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gdi2Q61598 445 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Fam189a1Q6A044 515 aa14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gpr75Q6X632 540 aa14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Zik1Q80YP6 463 aa14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cldn17Q8BXA6 224 aa14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Senp8Q9D2Z4 221 aa14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 BC034090A0A087WP46 1202 aa14.63□□□□□ -0.07
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Olfr59B1ARL3 323 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 82.7 ms