RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL3P39023 403 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL6P41182 706 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 HSF1Q00613 529 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 RHAGQ02094 409 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ADPRMQ3LIE5 342 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PAGE2Q7Z2X7 111 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 COMMD6Q7Z4G1 85 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ARPINQ7Z6K5 226 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF227Q86WZ6 799 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 DOLPP1Q86YN1 238 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD9Q8NBP5 474 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC58Q96CX6 371 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 LANCL2Q9NS86 450 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SGK494L7N484 410 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ASNA1O43681 348 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC74AQ0VAA2 488 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MEP1AQ16819 746 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ADCK2Q7Z695 626 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8J2Q8NGG1 315 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC13A3Q8WWT9 602 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS33AQ96AX1 596 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MTERF3Q96E29 417 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51B5Q9H339 312 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCD2Q9UBJ2 740 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 AP3M1Q9Y2T2 418 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRR3A8MPY1 467 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 FXYD1O00168 92 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 S100A3P33764 101 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTR3P61158 418 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PWP1Q13610 501 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 EXT1Q16394 746 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TIGD2Q4W5G0 525 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PAGE3Q5JUK9 113 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH24Q86UP0 819 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 RGMAQ96B86 450 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TSSK3Q96PN8 268 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 RMND5AQ9H871 391 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MYNNQ9NPC7 610 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CD300AQ9UGN4 299 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V1HQ9UI12 483 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDH7O60245 1069 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SP1P08047 785 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ME2P23368 584 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF763Q0D2J5 394 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 NFYCQ13952 458 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPKAPK3Q16644 382 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SFT2D3Q587I9 215 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 DLEU7Q6UYE1 221 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 C3P1Q6ZMU1 363 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 KCT2Q8NC54 265 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PLPP5Q8NEB5 264 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2H4Q92759 462 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TSLPQ969D9 159 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 COQ8BQ96D53 544 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MCCC2Q9HCC0 563 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-216ENST00000628306 FEZF1A0PJY2 475 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 LRIT2A6NDA9 550 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX19O60806 448 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 RDH16O75452 317 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ERN1O75460 977 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CD46P15529 392 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A2P23975 617 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TLE4Q04727 773 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SPANXN4Q5MJ08 99 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A25Q6KCM7 469 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NATD1Q8N6N6 113 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CLPTM1LQ96KA5 538 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 EGLN2Q96KS0 407 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 POMPQ9Y244 141 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 E9PLN8 166 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJA2O60884 412 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB6O75190 326 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX5P17844 614 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 IGFBP2P18065 325 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 BSGP35613 385 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPC1P48995 793 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 DGKQP52824 942 aa22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms