RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 RASD1Q9Y272 281 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CPQQ9Y646 472 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ACOT7O00154 380 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CT45A6P0DMU7 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CT45A5P0DMU8 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CT45A7P0DMV0 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CT45A8P0DMV1 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CT45A9P0DMV2 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GP1BBP13224 206 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PKLRP30613 574 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UGCGQ16739 394 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PMM1Q92871 262 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DDIT4LQ96D03 193 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HBEGFQ99075 208 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 IQCF5A8MTL0 148 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TCEAL1Q15170 157 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LMLNQ96KR4 655 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MUS81Q96NY9 551 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EBF1Q9UH73 591 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PXDNQ92626 1479 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 XKRY2A2RUG3 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BCHEP06276 602 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EBLN1P0CF75 366 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF681Q96N22 645 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TRIB1Q96RU8 372 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GABARAPH6UMI1 98 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MANBAO00462 879 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFS4O43181 175 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GPR37L1O60883 481 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GABARAPO95166 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC2A1P11166 492 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C6P13671 934 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CX3CR1P49238 355 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 IRF4Q15306 451 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CACUL1Q86Y37 369 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LIPT1Q9Y234 373 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 COTL1Q14019 142 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM156Q8N614 296 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 IMPA2O14732 288 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MBP02144 154 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TFP02787 698 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 S100A8P05109 93 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRKAR1BP31321 381 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FUT2Q10981 343 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GPC2Q8N158 579 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 REEP4Q9H6H4 257 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RNF150Q9ULK6 438 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TYROBPO43914 113 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINA7P05543 415 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ADH4P08319 380 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GKP32189 559 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RELAQ04206 551 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.68□□□□□ -1.34
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