RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593072.5

EFTUD2-225, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 5

Gene EFTUD2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-225	ENST00000593072	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	RNF175	Q8N4F7	328 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	RIT1	Q92963	219 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	WNT2B	Q93097	391 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	UCN3	Q969E3	161 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	PGM2	Q96G03	612 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	FBXL20	Q96IG2	436 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	VPS39	Q96JC1	886 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	KCNC2	Q96PR1	638 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	GSX2	Q9BZM3	304 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR51B5	Q9H339	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	UBQLN3	Q9H347	655 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	CENPH	Q9H3R5	247 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	PIGM	Q9H3S5	423 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	NT5DC2	Q9H857	520 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	PPCS	Q9HAB8	311 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	SERHL	Q9NQF3	203 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	WWOX	Q9NZC7	414 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	OARD1	Q9Y530	152 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A1W2PNV4	684 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A1W2PPM1	405 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072		H3BQF6	201 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	PLOD2	O00469	737 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TAPBP	O15533	448 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TNFSF13	O75888	250 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	GPR75	O95800	540 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TGM6	O95932	706 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	ACTL6A	O96019	429 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	CPN1	P15169	458 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	CNTF	P26441	200 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	PTPN6	P29350	595 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	GMPR	P36959	345 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	CD79B	P40259	229 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	SLC6A12	P48065	614 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	HNMT	P50135	292 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	RAP1GDS1	P52306	607 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	NRG3	P56975	720 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	SLC37A1	P57057	533 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TAS2R39	P59534	338 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	PLIN5	Q00G26	463 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	IRF8	Q02556	426 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	CHIT1	Q13231	466 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	GAB1	Q13480	694 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	NNAT	Q16517	81 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRABD2A	Q86V40	505 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	GPR180	Q86V85	440 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	MEIOB	Q8N635	442 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TANK	Q92844	425 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	TLCD1	Q96CP7	247 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	STARD4	Q96DR4	205 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-225	ENST00000593072	GPR22	Q99680	433 aa		5.75	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms