RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590638.5

NEDD4L-230, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD4L, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-230ENST00000590638 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 TMEM198Q66K66 360 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 ATG9BQ674R7 924 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 IYDQ6PHW0 289 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SCIMPQ6UWF3 145 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 Q6ZPA2 131 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 Q6ZSR9 355 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 C17orf64Q86WR6 236 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 NRROSQ86YC3 692 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 LAS2Q8IYD9 372 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SELENOMQ8WWX9 145 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 HTRA1Q92743 480 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 NEIL2Q969S2 332 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 UBE2E3Q969T4 207 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 REPS1Q96D71 796 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 WDR34Q96EX3 536 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 IL17FQ96PD4 163 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 TIMP4Q99727 224 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 NUAK2Q9H093 628 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 EHD1Q9H4M9 534 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF385DQ9H6B1 395 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 ASIC5Q9NY37 505 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PLAGL1Q9UM63 463 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 RCE1Q9Y256 329 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 THADAQ6YHU6 1953 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 A0A0G2JNG1 304 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 A6NCN8 305 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CFAP73A6NFT4 308 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 VILLO15195 856 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PEX11AO75192 247 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PDYNP01213 254 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CSF2P04141 144 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 WNT1P04628 370 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CSF1P09603 554 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 COX4I1P13073 169 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 BCKDHBP21953 392 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PIK3R1P27986 724 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PKLRP30613 574 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SHMT2P34897 504 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 HOXD12P35452 270 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 PGM1P36871 562 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 ACADVLP49748 655 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SLC37A1P57057 533 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 EMX2Q04743 252 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 GAB1Q13480 694 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 KIR2DS5Q14953 304 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 ELOCQ15369 112 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 KIF19Q2TAC6 998 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SGO1Q5FBB7 561 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 FRG2Q64ET8 278 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 MED27Q6P2C8 311 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 ASRGL1Q7L266 308 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 LONP2Q86WA8 852 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 GKN2Q86XP6 184 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 SFRP1Q8N474 314 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 AVL9Q8NBF6 648 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 OR2T11Q8NH01 316 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 KLHL29Q96CT2 875 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD4L-230ENST00000590638 FRG2BQ96QU4 278 aa7.35□□□□□ -1.23
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