RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, human

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	BUB3	O43684	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TM7SF2	O76062	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TOX	O94900	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	HNF1A	P20823	631 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CCNC	P24863	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CRYBA2	P53672	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ACTR3	P61158	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ITPK1	Q13572	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ALG9	Q9H6U8	611 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NSD2	O96028	1365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	KANK1	Q14678	1352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550		A0A1B0GUV1	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	EI24	O14681	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF208	O43345	1280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR1F1	O43749	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PCDH7	O60245	1069 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	KLHL41	O60662	606 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CAPN1	P07384	714 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CDK4	P11802	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NT5E	P21589	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	FCGR2C	P31995	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	RFC2	P35250	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	THBS3	P49746	956 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	MESD	Q14696	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550		Q7L0L9	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PKIB	Q9C010	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550		Q9HAA7	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550		A0A087WW49	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550		H3BMH7	237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF195	O14628	629 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	IMPA2	O14732	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ARPC3	O15145	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	KRT36	O76013	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NEBL	O76041	1014 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	IGHE	P01854	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CPN1	P15169	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	BNIP1	Q12981	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TFDP1	Q14186	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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