RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588552.5

PTPRS-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRS, Length 5,443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-206ENST00000588552 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 THAP4Q8WY91 577 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 EGFP01133 1207 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 XCR1P46094 333 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 DCDC1P59894 354 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SGCAQ16586 387 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CDKN3Q16667 212 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ZFP69Q49AA0 526 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 FBXO27Q8NI29 283 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 DMPKQ09013 629 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 TUBB3Q13509 450 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CDH24Q86UP0 819 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SLC41A3Q96GZ6 507 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CST11Q9H112 138 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 VAPAQ9P0L0 249 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 BCORQ6W2J9 1755 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SCN9AQ15858 1988 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 LDB3O75112 727 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 RETP07949 1114 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ITIH1P19827 911 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ARHGDIBP52566 201 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 FKBP10Q96AY3 582 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 HAVCR1Q96D42 359 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 E2F3O00716 465 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CER1O95813 267 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PSKH1P11801 424 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PLP2Q04941 152 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 BTBD16Q32M84 506 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 BMFQ96LC9 184 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ABCA3Q99758 1704 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SH3PXD2BA1X283 911 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PRAMEF10O60809 474 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CKMT1AP12532 417 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PRKCAP17252 672 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 EMP2P54851 167 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ACTC1P68032 377 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ACTA1P68133 377 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ASRGL1Q7L266 308 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 THRSPQ92748 146 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF12P17014 697 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CELP19835 753 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 S1PR1P21453 382 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 GADD45AP24522 165 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PGFP49763 221 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SELENOWP63302 87 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 FAM189A2Q15884 450 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 RNF175Q8N4F7 328 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 OMA1Q96E52 524 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 MSANTD3Q96H12 275 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 FOLR3P41439 243 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 MS4A2Q01362 244 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms