RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	RFK	Q969G6	155 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	FUZ	Q9BT04	418 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	MED18	Q9BUE0	208 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	SARG	Q9BW04	601 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ASPN	Q9BXN1	380 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR51I1	Q9H343	314 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	SNX7	Q9UNH6	387 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	HYKK	A2RU49	373 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	AXIN1	O15169	862 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	EMC8	O43402	210 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADAM23	O75077	832 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCCB	P05166	539 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	EPHX1	P07099	455 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR12D1	P0DN82	309 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	C5AR1	P21730	350 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	NDUFS1	P28331	727 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	CMPK1	P30085	196 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC6A11	P48066	632 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	GIPR	P48546	466 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLCNKA	P51800	687 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	CYP4F2	P78329	520 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF91	Q05481	1191 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRAM2	Q15035	370 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZIC1	Q15915	447 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	HSDL2	Q6YN16	418 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADCK2	Q7Z695	626 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	OPALIN	Q96PE5	141 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	MED17	Q9NVC6	651 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	RHCG	Q9UBD6	479 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM129	A0AVI4	362 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	LRIT2	A6NDA9	550 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	CHST10	O43529	356 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	DYRK3	O43781	588 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDH8	O95206	1070 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	RECK	O95980	971 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADRB1	P08588	477 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	GAA	P10253	952 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PKLR	P30613	574 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRIM23	P36406	574 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	STAT5A	P42229	794 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	ST3GAL3	Q11203	375 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	SGCG	Q13326	291 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	GINS1	Q14691	196 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-223	ENST00000588516	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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