RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF607Q96SK3 696 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM168Q9H0V1 697 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 ATRXP46100 2492 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 PDZK1P1A8MUH7 402 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 RTCAO00442 366 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 ACVR2AP27037 513 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 GNA13Q14344 377 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 C3orf38Q5JPI3 329 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2L5Q8NG80 312 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A18Q96BI1 424 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 TESMINQ9Y4I5 508 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 SPDYE7PQ495Y7 208 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 ADCK2Q7Z695 626 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 LGI4Q8N135 537 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 HORMAD2Q8N7B1 307 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL4L1Q8NHW4 92 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 DHRS1Q96LJ7 313 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 DPH7Q9BTV6 452 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 PRDM9Q9NQV7 894 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 ACER3Q9NUN7 267 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 ENPP5Q9UJA9 477 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX8Q9Y5X2 465 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQM1 296 aa23.9■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 CD247P20963 164 aa23.9■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 SFTPA2Q8IWL1 248 aa23.9■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 FKBP10Q96AY3 582 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 MS4A6EQ96DS6 147 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 THAP11Q96EK4 314 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 BCL2L10Q9HD36 194 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A20Q9NP91 592 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 P2RX2Q9UBL9 471 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa23.9■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRAMEF10O60809 474 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINB7O75635 380 aa23.89■■□□□ 1.41
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CAPNS1-204ENST00000587718 MFN2O95140 757 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 OPN1SWP03999 348 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL7P80098 99 aa23.89■■□□□ 1.41
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CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa23.89■■□□□ 1.41
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC5A8Q8N695 610 aa23.89■■□□□ 1.41
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CAPNS1-204ENST00000587718 AMDHD1Q96NU7 426 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKMY1Q9P2S6 941 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 SSUH2Q9Y2M2 353 aa23.89■■□□□ 1.41
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CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAMEF25A6NGN4 478 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 CDRT15L2A8MXV6 281 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 MPZL2O60487 215 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 GADD45GO95257 159 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 CBLP22681 906 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 KHKP50053 298 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH12P55289 794 aa23.88■■□□□ 1.41
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