RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 EVI2BP34910 448 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 LUMP51884 338 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 IER5LQ5T953 404 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SLC16A9Q7RTY1 509 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF709Q8N972 641 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 OR52N2Q8NGI0 321 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 OR14K1Q8NGZ2 314 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 APIPQ96GX9 242 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 B8ZZF3 427 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SSX4O60224 188 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 LAMP1P11279 417 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 LRFN4Q6PJG9 635 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 FTMTQ8N4E7 242 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 OR52E2Q8NGJ4 325 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 MYNNQ9NPC7 610 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 GXYLT2A0PJZ3 443 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 NUDT7P0C024 238 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF1BP20333 461 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 FGL1Q08830 312 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 GNMTQ14749 295 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM35AQ53FP2 167 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SHDQ96IW2 340 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 MYH8P13535 1937 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 UCHL1P09936 223 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF84P51523 738 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 FGFBP1Q14512 234 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 RNF111Q6ZNA4 994 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SHFQ7M4L6 423 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 BEST3Q8N1M1 668 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 OR8K5Q8NH50 307 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 OR5B12Q96R08 314 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GVG6 124 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 HMGCLP35914 325 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 MS4A2Q01362 244 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 KAT6AQ92794 2004 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 IGLON5A6NGN9 336 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 AMY2BP19961 511 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 CAPN3P20807 821 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEA6P43360 314 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SCGB1C1Q8TD33 95 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 NLKQ9UBE8 527 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 GPR52Q9Y2T5 361 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ADAP00813 363 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 FBLP22087 321 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 CNR2P34972 360 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 MTNR1AP48039 350 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 MANEALQ5VSG8 457 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf33Q6P1S2 294 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 NDNFQ8TB73 568 aa20.31■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 WNT7BP56706 349 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 OR4N5Q8IXE1 308 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 LAS2Q8IYD9 372 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 KATNBL1Q9H079 304 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.31■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 PLBD1Q6P4A8 553 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SERINC5Q86VE9 423 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 TEX26Q8N6G2 289 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.31■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF611Q8N823 705 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ABHD11Q8NFV4 315 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.31■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 GABRQQ9UN88 632 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 F8W036 122 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 PFKMP08237 780 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 C6P13671 934 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 RAB3BP20337 219 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ART1P52961 327 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 BLOC1S1P78537 153 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SLC7A11Q9UPY5 501 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SPINT3P49223 89 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 RGNQ15493 299 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 MICAQ29983 383 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ATAD3CQ5T2N8 411 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ELP2Q6IA86 826 aa20.3■□□□□ 0.84
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