RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575927.1

CYCSP40-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 40, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP40, Length 294 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP40-201ENST00000575927 DUSP2Q05923 314 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 ADAM15Q13444 863 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 HTR4Q13639 388 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 TRAM2Q15035 370 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 NCF4Q15080 339 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 MED22Q15528 200 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 ZNF311Q5JNZ3 666 aa4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 MFSD4BQ5TF39 518 aa4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 CDC73Q6P1J9 531 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 C1orf94Q6P1W5 598 aa4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 C16orf62Q7Z3J2 963 aa4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 ZNF681Q96N22 645 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 MS4A4EQ96PG1 132 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 MGLLQ99685 303 aa4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 ACTRT3Q9BYD9 372 aa4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP40-201ENST00000575927 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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CYCSP40-201ENST00000575927 FAM170BA6NMN3 283 aa4.58□□□□□ -1.68
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CYCSP40-201ENST00000575927 TNFSF14O43557 240 aa4.58□□□□□ -1.68
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CYCSP40-201ENST00000575927 SEMA7AO75326 666 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 CSO75390 466 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 UBXN7O94888 489 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 RAB36O95755 333 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 EML2O95834 649 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 EPPINO95925 133 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 TP53P04637 393 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 CCNYL3P0C7X3 344 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 SMIM10L1P0DMW3 83 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 TNNI3P19429 210 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP40-201ENST00000575927 MAGP20916 626 aa4.58□□□□□ -1.68
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