RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572787.1

TOPBP1-210, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 4

Gene TOPBP1, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-210	ENST00000572787	TSSK3	Q96PN8	268 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	RIT2	Q99578	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	EMCN	Q9ULC0	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787		A6NNC1	897 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787		E7EWF7	191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787		H3BTX0	84 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	CLOCK	O15516	846 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	LAT	O43561	262 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	SYT7	O43581	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	SNX3	O60493	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	CIAO1	O76071	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	RPN2	P04844	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	F13B	P05160	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	IRF2	P14316	349 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	ITGB7	P26010	798 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	PPP2R1B	P30154	601 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	AVPR1A	P37288	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	ACTR1B	P42025	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	ACADSB	P45954	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	TGM4	P49221	684 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	SERPINB9	P50453	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	ART1	P52961	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	PLA2G16	P53816	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	ATP5J2	P56134	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	REEP5	Q00765	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	MYBPH	Q13203	477 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	DOC2B	Q14184	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	HNF4G	Q14541	408 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	ZNF691	Q5VV52	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	ULK3	Q6PHR2	472 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787		Q6ZUG5	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	KY	Q8NBH2	561 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	FAM3C	Q92520	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-210	ENST00000572787	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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