RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 DUSP2Q05923 314 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 BTKQ06187 659 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 LTB4RQ15722 352 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CFAP157Q5JU67 520 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SPDYAQ5MJ70 313 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM198Q66K66 360 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SCIMPQ6UWF3 145 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ACAD11Q709F0 780 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GDF7Q7Z4P5 450 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PRR22Q8IZ63 422 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 NINQ8N4C6 2090 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC63Q8NA47 563 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ADCY4Q8NFM4 1077 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 RDH11Q8TC12 318 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SPPL2AQ8TCT8 520 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 RND1Q92730 232 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SARAFQ96BY9 339 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 APIPQ96GX9 242 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF681Q96N22 645 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GIMAP4Q9NUV9 329 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 QPCTLQ9NXS2 382 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 HEY2Q9UBP5 337 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF639Q9UID6 485 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ACAD8Q9UKU7 415 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 APCP25054 2843 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SERTM1A2A2V5 107 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 C19orf84I3L1E1 186 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SNX4O95219 450 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CBX7O95931 251 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CPA3P15088 417 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GDF1P27539 372 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ABCD3P28288 659 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CHRNB4P30926 498 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MDH1P40925 334 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GSTM5P46439 218 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 NAGLUP54802 743 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 DNAJB13P59910 316 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 DUSP8Q13202 625 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 HEPACAMQ14CZ8 416 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 NNATQ16517 81 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 IMPG1Q17R60 797 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 WLSQ5T9L3 541 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FAM180BQ6P0A1 224 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF585AQ6P3V2 769 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 GALNT18Q6P9A2 607 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FRMD7Q6ZUT3 714 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 EXOC3L1Q86VI1 746 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 LIX1Q8N485 282 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 RPRMLQ8N4K4 120 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 OR52R1Q8NGF1 315 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF675Q8TD23 568 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 C16orf78Q8WTQ4 265 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CTHRC1Q96CG8 243 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 RILPQ96NA2 401 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ITPAQ9BY32 194 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ACKR4Q9NPB9 350 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SENP1Q9P0U3 644 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PRODH2Q9UF12 536 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MID2Q9UJV3 735 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 RNF6Q9Y252 685 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 DTX4Q9Y2E6 619 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PLLPQ9Y342 182 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ACOX3O15254 700 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 WDR1O75083 606 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PPM1BO75688 479 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PCSK2P16519 638 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 NAGAP17050 411 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 KRT4P19013 534 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MASP1P48740 699 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 FOXA1P55317 472 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 NUP107P57740 925 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 DCAF7P61962 342 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PLCXD2Q0VAA5 305 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PMPCAQ10713 525 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 BICRALQ6AI39 1079 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 PACS2Q86VP3 889 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC116Q8IYX3 515 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 C4orf33Q8N1A6 199 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 CDC26Q8NHZ8 85 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 HSPBAP1Q96EW2 488 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 EBPLQ9BY08 206 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 ANGPTL4Q9BY76 406 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-215ENST00000568477 SLC6A15Q9H2J7 730 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms