RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 NR4A3Q92570 626 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 ART5Q96L15 291 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 C3orf30Q96M34 536 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 ZNF681Q96N22 645 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 TSSK3Q96PN8 268 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 OR10A5Q9H207 317 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 DEPPQ9NTK1 212 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 SENP1Q9P0U3 644 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 PSME2Q9UL46 239 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.59□□□□□ -1.19
LINS1-211ENST00000560941 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 H3BQF6 201 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 RGS14O43566 566 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 HS6ST1O60243 411 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 PEX11AO75192 247 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 PDE9AO76083 593 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 AGFG2O95081 481 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 HSPA4LO95757 839 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 CBX7O95931 251 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 CHEK2O96017 543 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 FGF4P08620 206 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 MYZAPP0CAP1 466 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 CCL3P10147 92 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 EDN3P14138 238 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 DRD2P14416 443 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 GALNSP34059 522 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 PIGAP37287 484 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 DNASE1L1P49184 302 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 RPL38P63173 70 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 FUT7Q11130 342 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 CASP8Q14790 479 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 GFRALQ6UXV0 394 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 OR8K3Q8NH51 312 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 NUBPLQ8TB37 319 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 ARL8AQ96BM9 186 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 PGM2Q96G03 612 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 MAGED4Q96JG8 741 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 FRMD6Q96NE9 622 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 BBS4Q96RK4 519 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 TRMOQ9BU70 441 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 ITPAQ9BY32 194 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 C1orf109Q9NX04 203 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 STOML1Q9UBI4 398 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 ESPL1Q14674 2120 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 TMEM120BA0PK00 339 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 ASPDHA6ND91 283 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 FAM166BA8MTA8 275 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 TM9SF1O15321 606 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 ZWINTO95229 277 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 ATP1B1P05026 303 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 SERPINE1P05121 402 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 SDC1P18827 310 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 DDCP20711 480 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 SLC1A6P48664 564 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.26e-6■■■■□ 20.8
LINS1-211ENST00000560941 FBXW4P57775 412 aa7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINS1-211ENST00000560941 PLGLB1Q02325 96 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms