RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 PHF11Q9UIL8 331 aa12.76□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 ATG4BQ9Y4P1 393 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 TRIM64BA6NI03 449 aa12.75□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 PEX1O43933 1283 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PRMT3O60678 531 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 LRTM1Q9HBL6 345 aa12.75□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PR48 441 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 SLCO1B7G3V0H7 640 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 HDAC3O15379 428 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PCDH7O60245 1069 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 B4GALT2O60909 372 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 SEC22BO75396 215 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ATP6AP2O75787 350 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 CPN2P22792 545 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 HSD17B7P56937 341 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 SLC26A5P58743 744 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 BTG2P78543 158 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TNFRSF17Q02223 184 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 NOXRED1Q6NXP6 359 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 QSOX2Q6ZRP7 698 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 SCUBE1Q8IWY4 988 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 SLC5A8Q8N695 610 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PLPP5Q8NEB5 264 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TM4SF18Q96CE8 201 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 COX4I2Q96KJ9 171 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 FCRL1Q96LA6 429 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PPP3R2Q96LZ3 170 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 MEAF6Q9HAF1 191 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PRDM9Q9NQV7 894 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 VTI1BQ9UEU0 232 aa12.74□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 MMACHCQ9Y4U1 282 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 CUBNO60494 3623 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ZNF407Q9C0G0 2248 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ATRQ13535 2644 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 A8MUA0 341 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 CLDN4O14493 209 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PEX11AO75192 247 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 GUCY1B2O75343 617 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 AIFM1O95831 613 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 CELA3AP09093 270 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 KITP10721 976 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 CD53P19397 219 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 MAOAP21397 527 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 CYB561P49447 251 aa12.73□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 GALNTL6Q49A17 601 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 C6orf136Q5SQH8 315 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 C18orf63Q68DL7 685 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 CAMKMTQ7Z624 323 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 LINC01560Q8TB33 94 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TUBGCP3Q96CW5 907 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 NUF2Q9BZD4 464 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 NECTIN3Q9NQS3 549 aa12.73□□□□□ -0.37
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