RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 COX7A2P14406 83 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 HRH2P25021 359 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 SOAT1P35610 550 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 DGKQP52824 942 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 RHAGQ02094 409 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 MPP2Q14168 576 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ADRM1Q16186 407 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 Q6ZS92 163 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 LINC01560Q8TB33 94 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 VMP1Q96GC9 406 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 MPP4Q96JB8 637 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ECSITQ9BQ95 431 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ABI3Q9P2A4 366 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ZNF225Q9UK10 706 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 OR7A17O14581 309 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 P04436 131 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 SP1P08047 785 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 SERPINA6P08185 405 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 MFAP5Q13361 173 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 TP53BP2Q13625 1128 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 TSC22D1Q15714 1073 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 MEP1AQ16819 746 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 PGS1Q32NB8 556 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 FRG2Q64ET8 278 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 RPTNQ6XPR3 784 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 KCNC2Q96PR1 638 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 FRG2BQ96QU4 278 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 HPP00738 406 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ALBP02768 609 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 NID1P14543 1247 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 CRABP2P29373 138 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 CPOXP36551 454 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 SSR4P51571 173 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 SLC18A1P54219 525 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 RNF4P78317 190 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 GBX1Q14549 363 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 PTGR1Q14914 329 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 CEBPEQ15744 281 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 MIER2Q8N344 545 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 RGMAQ96B86 450 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 LRFN5Q96NI6 719 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 PIF1Q9H611 641 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 MYOTQ9UBF9 498 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.96□□□□□ -1.29
CS-212ENST00000548567 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 E2F3O00716 465 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PRRG2O14669 202 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GSC2O15499 205 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 KERAO60938 352 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NR2F6P10588 404 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SFTPDP35247 375 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CPA2P48052 419 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GPR143P51810 404 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CASP6P55212 293 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.96□□□□□ -1.3
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