RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 ASIC5Q9NY37 505 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PSME2Q9UL46 239 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 TACC2O95359 2948 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 GLOD5A6NK44 160 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 SDHDO14521 159 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF195O14628 629 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 HS6ST1O60243 411 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 NME2P1O60361 137 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 TBX19O60806 448 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 IL3P08700 152 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 KITP10721 976 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PRPS2P11908 318 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 BCKDHAP12694 445 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 IGFBP2P18065 325 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 LBPP18428 481 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 SDC1P18827 310 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 DDCP20711 480 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 NME2P22392 152 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PIK3R1P27986 724 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ASMTP46597 345 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 STT3AP46977 705 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 CYB561P49447 251 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 DGKQP52824 942 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ERVK-8P63133 956 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PLIN5Q00G26 463 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PMPCAQ10713 525 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 CLNKQ7Z7G1 428 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5M3Q8NGP4 307 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 STON2Q8WXE9 905 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 HEY2Q9UBP5 337 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 IFNA16P05015 189 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC35E2P0CK97 266 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 COX7A2P14406 83 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 DNASE1P24855 282 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 TACR1P25103 407 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 NUP107P57740 925 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 C21orf58P58505 322 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC26A5P58743 744 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR85P60893 370 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 LTBQ06643 244 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 TFF3Q07654 80 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 C2orf80Q0P641 193 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 IL23RQ5VWK5 629 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 EPGNQ6UW88 154 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 MAVSQ7Z434 540 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4N5Q8IXE1 308 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 LIX1Q8N485 282 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 NINJ1Q92982 152 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 UCN3Q969E3 161 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 MTERF3Q96E29 417 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 EGLN2Q96KS0 407 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms