RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537529.6

MKS1-204, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-204ENST00000537529 GJD3Q8N144 294 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FLCNQ8NFG4 579 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 NDNFQ8TB73 568 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 RSC1A1Q92681 617 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 GIMAP5Q96F15 307 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 CRELD1Q96HD1 420 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 NTMQ9P121 344 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 DUXAA6NLW8 204 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 H3BN98 237 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 SOX14O95416 240 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 BMXP51813 675 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 VBP1P61758 197 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 COX10Q12887 443 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 DGUOKQ16854 277 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 C12orf73Q69YU5 71 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 Q96MT0 163 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ARHGDIGQ99819 225 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 LYRM4Q9HD34 91 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 PALMDQ9NP74 551 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 DAPP1Q9UN19 280 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 A0A0J9YY10 115 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ALOX12P18054 663 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ALDH4A1P30038 563 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 RUNX2Q13950 521 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 IRF3Q14653 427 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 CASP12Q6UXS9 341 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 TDHQ8IZJ6 230 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 OR7G2Q8NG99 324 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 FNDC8Q8TC99 324 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ZNF675Q8TD23 568 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 PATE1Q8WXA2 126 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 SPACA6W5XKT8 324 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 H0YGG7 62 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ADORA3P0DMS8 318 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 DGKEP52429 567 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 MLLT10P55197 1068 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 CHRNEQ04844 493 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 CDC73Q6P1J9 531 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 RNF44Q7L0R7 432 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 COL26A1Q96A83 441 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 F5P12259 2224 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 LRP4O75096 1905 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 SHISA7A6NL88 538 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 M0R082 166 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 CPMP14384 443 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 PRKAR1BP31321 381 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 LIPAP38571 399 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 TAS2R41P59536 307 aa14.69□□□□□ -0.06
MKS1-204ENST00000537529 NCS1P62166 190 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms