RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	KRT77	Q7Z794	578 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SERINC5	Q86VE9	423 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FAM228A	Q86W67	206 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	HDAC11	Q96DB2	347 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	RADIL	Q96JH8	1075 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	IFT74	Q96LB3	600 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TSG101	Q99816	390 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	DCTPP1	Q9H773	170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SPATA2	Q9UM82	520 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GRIN2D	O15399	1336 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	UTRN	P46939	3433 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MRC1	P22897	1456 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057		A0A0B4J203	849 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057		A0A0J9YVX5	310 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SYCE1L	A8MT33	242 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	LMO7DN	F2Z398	122 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057		M0QX08	132 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CPLX1	O14810	134 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	INPP4B	O15327	924 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF254	O75437	659 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	OR6B1	O95007	311 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	YEATS4	O95619	227 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FAM107A	O95990	144 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	IGHG1	P01857	330 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	HCK	P08631	526 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MYL6B	P14649	208 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CPA3	P15088	417 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CD1D	P15813	335 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	EPOR	P19235	508 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ATP6V1C1	P21283	382 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	HMOX2	P30519	316 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CHRNA3	P32297	505 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	KRT20	P35900	424 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ACADSB	P45954	432 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GPC3	P51654	580 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	HPCA	P84074	193 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CETN1	Q12798	172 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SLC39A6	Q13433	755 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NFE2L1	Q14494	772 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	COG2	Q14746	738 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	BCL2A1	Q16548	175 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	KCTD16	Q68DU8	428 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NEK5	Q6P3R8	708 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NLRP14	Q86W24	1093 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	EXT2	Q93063	718 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CFAP36	Q96G28	342 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	C8orf76	Q96K31	380 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	B3GALT6	Q96L58	329 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TPK1	Q9H3S4	243 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FN3K	Q9H479	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	WDR41	Q9HAD4	459 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PALMD	Q9NP74	551 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	INIP	Q9NRY2	104 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	EMC3	Q9P0I2	261 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91

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