RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516232.1

RNA5SP228-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 228, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP228, Length 133 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP228-201ENST00000516232 A0A0J9YYE9 177 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 A0A0U1RQJ8 604 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 LILRA5A6NI73 299 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM210A6NLX4 147 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 A6NNC1 897 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 E9PLN8 166 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 H3BQV1 296 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 ADAM10O14672 748 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 HCRTR2O43614 444 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 LIASO43766 372 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 KLK8O60259 260 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 TRBC1P01850 177 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 LCATP04180 440 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CD1AP06126 327 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 GRPP07492 148 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 SBK2P0C263 348 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 STAG3L2P0CL84 134 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 G6PDP11413 515 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 TCF4P15884 667 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 ATP6V1C1P21283 382 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CFPP27918 469 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CHRNB4P30926 498 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 SERPINB6P35237 376 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 MMP12P39900 470 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 PPP1R2P41236 205 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 FOLR3P41439 243 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CAPZBP47756 277 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 HSPA13P48723 471 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CDH4P55283 916 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 STX17P56962 302 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 PPP1CAP62136 330 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 TNP2Q05952 138 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CALCOCO2Q13137 446 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 DYRK1AQ13627 763 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 SNAPC1Q16533 368 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CHRFAM7AQ494W8 412 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 C6orf163Q5TEZ5 329 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 PNCKQ6P2M8 343 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM81Q6P7N7 255 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 TUBA3EQ6PEY2 450 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 LIPIQ6XZB0 460 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 NLRP9Q7RTR0 991 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 ASPGQ86U10 573 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM131BQ86XD5 332 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 Q8N1Y9 231 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 UBE2J2Q8N2K1 259 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 FNDC5Q8NAU1 212 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 OR2AP1Q8NGE2 309 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 ASB5Q8WWX0 329 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 IRGQQ8WZA9 623 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 LPGAT1Q92604 370 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 WNT2BQ93097 391 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 SLC35B4Q969S0 331 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 MCUR1Q96AQ8 359 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 MISP3Q96FF7 219 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM68Q96MH6 324 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 LRFN5Q96NI6 719 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CHP1Q99653 195 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 MIS12Q9H081 205 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 ATG10Q9H0Y0 220 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 UBQLN3Q9H347 655 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 PLK3Q9H4B4 646 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 NTN4Q9HB63 628 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 NEK6Q9HC98 313 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 SLC6A20Q9NP91 592 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 OR6C3Q9NZP0 311 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 HESX1Q9UBX0 185 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 CTSFQ9UBX1 484 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 UBQLN2Q9UHD9 624 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.75□□□□□ -1.65
RNA5SP228-201ENST00000516232 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms