RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515711.1

LMNA-224, Transcript of lamin A/C, human

TSL 5

Gene LMNA, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMNA-224	ENST00000515711	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SCN2A	Q99250	2005 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF749	O43361	778 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	PCDHGA12	O60330	932 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	CTNS	O60931	367 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	MFN2	O95140	757 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	IFNW1	P05000	195 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	LYN	P07948	512 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	CD247	P20963	164 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	NT5E	P21589	574 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	MAN2A2	P49641	1150 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	HSD17B7	P56937	341 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	PPP2R2B	Q00005	443 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	BLMH	Q13867	455 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SLC36A3	Q495N2	470 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	GPAT3	Q53EU6	434 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	FHL5	Q5TD97	284 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	MED25	Q71SY5	747 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	NR4A3	Q92570	626 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	KAT2A	Q92830	837 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	LOXL4	Q96JB6	756 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	STAC	Q99469	402 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SATB2	Q9UPW6	733 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711		A0A1W2PS29	197 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	TTC36	A6NLP5	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711		A8MVJ9	347 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711		H3BMH7	237 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	DLGAP1	O14490	977 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	ARHGAP33	O14559	1287 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SIGLEC6	O43699	453 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	OR10H2	O60403	315 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	LDB3	O75112	727 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	CPNE6	O95741	557 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	ALOX5	P09917	674 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	RHCE	P18577	417 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	MYF6	P23409	242 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	GALNS	P34059	522 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	KCNJ5	P48544	419 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	ACY1	Q03154	408 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	CFHR1	Q03591	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	STX4	Q12846	297 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SLC13A2	Q13183	592 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	MAPK11	Q15759	364 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	SYPL1	Q16563	259 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	TTC23	Q5W5X9	447 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	PMM1	Q92871	262 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LMNA-224	ENST00000515711	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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