RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 OGFOD2Q6N063 350 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 H3F3CQ6NXT2 135 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 IGFL3Q6UXB1 125 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 Q6ZS92 163 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 SZRD1Q7Z422 152 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAVSQ7Z434 540 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 BEST3Q8N1M1 668 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM156Q8N614 296 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR7G1Q8NGA0 311 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 SUN3Q8TAQ9 357 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAGED4Q96JG8 741 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 MARK4Q96L34 752 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 AMDHD1Q96NU7 426 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR52B2Q96RD2 323 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR10A5Q9H207 317 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 GLIPR2Q9H4G4 154 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 TCF7L2Q9NQB0 619 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ANKRD10Q9NXR5 420 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAT2BQ9NZL9 334 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ATP6V1HQ9UI12 483 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 CFL2Q9Y281 166 aa10.17□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 A0A1B0GUH1 482 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 A0A1W2PRB8 838 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR6C76A6NM76 312 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 E9PBE3 544 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF195O14628 629 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 CFLARO15519 480 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAN1A2O60476 641 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 TBX19O60806 448 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRAMEF2O60811 474 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ITGA10O75578 1167 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR2J2O76002 312 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 IGKV3-11P04433 115 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 LAMP1P11279 417 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 EDN3P14138 238 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 SSR4P51571 173 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC37A1P57057 533 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 MLF1P58340 268 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 STX1BP61266 288 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 FUT7Q11130 342 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ART3Q13508 389 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 PDE7AQ13946 482 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 GSTA3Q16772 222 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 SPDYE7PQ495Y7 208 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF385BQ569K4 471 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF628Q5EBL2 1059 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM198Q66K66 360 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM107Q6UX40 140 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 LGI4Q8N135 537 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 NATD1Q8N6N6 113 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 HORMAD2Q8N7B1 307 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 VPS37AQ8NEZ2 397 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR52R1Q8NGF1 315 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR8K3Q8NH51 312 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 GRHL3Q8TE85 626 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 NUDT8Q8WV74 236 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 EBF4Q9BQW3 602 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 DUSP26Q9BV47 211 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 AIG1Q9NVV5 245 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 MYOTQ9UBF9 498 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRODH2Q9UF12 536 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 PCDHGB4Q9UN71 923 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERVK-11Q9UQG0 969 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 CSAG2Q9Y5P2 127 aa10.16□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR5H15A6NDH6 313 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC22A3O75751 556 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLITRK5O94991 958 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 STSP08842 583 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 S100A3P33764 101 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 CD96P40200 585 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 MC3RP41968 323 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIR3DL1P43629 444 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 CYB561P49447 251 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRKAG1P54619 331 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 UFM1P61960 85 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 MGAT2Q10469 447 aa10.15□□□□□ -0.78
CD27-AS1-204ENST00000504270 TLR1Q15399 786 aa10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms