RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 PODNL1Q6PEZ8 512 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 RPTNQ6XPR3 784 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF367Q7RTV3 350 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SCRN2Q96FV2 425 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 B3GNT4Q9C0J1 378 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 STUB1Q9UNE7 303 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 L7N2F9 121 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 FABP7O15540 132 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CHRNB1P11230 501 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 STOMP27105 288 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ACTR1BP42025 376 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ACTR1AP61163 376 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CAP1Q01518 475 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF627Q7L945 461 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 BHLHA9Q7RTU4 235 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 OR9A1PQ8NGU1 263 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 RFKQ969G6 155 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC12A9Q9BXP2 914 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 RASD1Q9Y272 281 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ALG5Q9Y673 324 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PTPRFP10586 1907 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 M0R233 179 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 UPK1AO00322 258 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PITPNM1O00562 1244 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ARPC5O15511 151 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 B4GALT2O60909 372 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CCR6P51684 374 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 DSG2Q14126 1118 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 P2RY14Q15391 338 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF385BQ569K4 471 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 RFT1Q96AA3 541 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ARL6Q9H0F7 186 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SLITRK2Q9H156 845 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa11.72□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ADH1AP07327 375 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 IL1RNP18510 177 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 FUT1P19526 365 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ITGB8P26012 769 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PRR5P85299 388 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 RING1Q06587 406 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MGAT3Q09327 533 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 VRK2Q86Y07 508 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 POGLUT1Q8NBL1 392 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC38A5Q8WUX1 472 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SMPDL3AQ92484 453 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ITPKCQ96DU7 683 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF32Q9H0A6 362 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0C4DFX4 3053 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 LYPD8Q6UX82 237 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 NUS1Q96E22 293 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 THSD1Q9NS62 852 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MAU2Q9Y6X3 613 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 BTAF1O14981 1849 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.71□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 K7ESM1 405 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SPDEFO95238 335 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 RHCEP18577 417 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MC3RP41968 323 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HCCSP53701 268 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 KEAP1Q14145 624 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB110Q30KQ9 67 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ALKAL2Q6UX46 152 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 VITQ6UXI7 678 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 LRRTM4Q86VH4 590 aa11.71□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TEX26Q8N6G2 289 aa11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms