RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	GLOD5	A6NK44	160 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TP53I11	O14683	189 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PIP5K1B	O14986	540 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ITM2A	O43736	263 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SASH3	O75995	380 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CPM	P14384	443 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NRG3	P56975	720 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR85	P60893	370 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PLGLB1	Q02325	96 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC10A1	Q14973	349 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	GALNTL6	Q49A17	601 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ACAD11	Q709F0	780 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ACBD4	Q8NC06	268 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MARVELD3	Q96A59	401 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM233	B4DJY2	109 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	AQP7	O14520	342 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF11	O14901	512 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX4	O95219	450 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CLPS	P04118	112 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL3	P10147	92 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF7	P61962	342 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf80	Q0P641	193 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	EBPL	Q9BY08	206 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10A5	Q9H207	317 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MED4	Q9NPJ6	270 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		15.91	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HRK	O00198	91 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	S1PR1	P21453	382 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ASMT	P46597	345 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HSF1	Q00613	529 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZSR9	355 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIL	Q7L0X0	811 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CD163	Q86VB7	1156 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SARAF	Q96BY9	339 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL29	Q96CT2	875 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NTNG2	Q96CW9	530 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	EHD3	Q9NZN3	535 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF639	Q9UID6	485 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HAO1	Q9UJM8	370 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PINLYP	A6NC86	204 aa		15.89	■□□□□ 0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		15.89	■□□□□ 0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		15.89	■□□□□ 0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	ACOX3	O15254	700 aa		15.89	■□□□□ 0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR1	O75083	606 aa		15.89	■□□□□ 0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	PEX11A	O75192	247 aa		15.89	■□□□□ 0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	TPO	P07202	933 aa		15.89	■□□□□ 0.13
HDAC10-216	ENST00000489424	IL3	P08700	152 aa		15.89	■□□□□ 0.13

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms