RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 GNG11P61952 73 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PHEXP78562 749 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 IRF9Q00978 393 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXF2Q12947 444 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CALCOCO2Q13137 446 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CUL3Q13618 768 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 VEZF1Q14119 521 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SETDB1Q15047 1291 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TOMM20Q15388 145 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PFKFB4Q16877 469 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 LIPJQ5W064 366 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 LUZP2Q86TE4 346 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 NUDT13Q86X67 352 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 MEIOBQ8N635 442 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ISL2Q96A47 359 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 NXNL1Q96CM4 212 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 REPS1Q96D71 796 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ERP44Q9BS26 406 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10A5Q9H207 317 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CALHM2Q9HA72 323 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 WHRNQ9P202 907 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FREM3P0C091 2139 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SYCE1LA8MT33 242 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GNB5O14775 395 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 UGDHO60701 494 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PPM1BO75688 479 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SEMA3DO95025 777 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GSTA2P09210 222 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CYP4B1P13584 511 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CPMP14384 443 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 S1PR1P21453 382 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PIK3R1P27986 724 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PAFAH1B1P43034 410 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SLCO1A2P46721 670 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 XKP51811 444 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GTF2H2Q13888 395 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 RCAN2Q14206 197 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 NNATQ16517 81 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 DESI1Q6ICB0 168 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 C17orf47Q8NEP4 570 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 OR7G1Q8NGA0 311 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR20Q8TBZ3 569 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SERHLQ9NQF3 203 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FETUBQ9UGM5 382 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ACOT9Q9Y305 439 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 TGP01266 2768 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 HMX2A2RU54 273 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 C2orf72A6NCS6 295 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM187AA6NFU0 413 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 SNPHO15079 494 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 RAD51CO43502 376 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ERN1O75460 977 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTL6AO96019 429 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 C2P06681 752 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 KLK1P06870 262 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CPN1P15169 458 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 KRT15P19012 456 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 NT5EP21589 574 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 GPX3P22352 226 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CNTFP26441 200 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 STX2P32856 288 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 PTGDSP41222 190 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 CPA2P48052 419 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP5J2P56134 94 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 MGAT2Q10469 447 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-210ENST00000481231 NAB1Q13506 487 aa8.55□□□□□ -1.04
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