RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.89■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 MICU2Q8IYU8 434 aa16.89■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.89■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 OR51I1Q9H343 314 aa16.89■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 GMEB1Q9Y692 573 aa16.89■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 C9orf172C9J069 976 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 TNFRSF21O75509 655 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 C8BP07358 591 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 SLC35E2P0CK97 266 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 HTR1EP28566 365 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 HSD17B7P56937 341 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 NSDHLQ15738 373 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 FAM86B1Q8N7N1 296 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 RIT1Q92963 219 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 MR1Q95460 341 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 GIMAP5Q96F15 307 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 HMGN4O00479 90 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 PLD2O14939 933 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 GSTA4O15217 222 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 EMC8O43402 210 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 MATN1P21941 496 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 DCAF12Q5T6F0 453 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 FHL5Q5TD97 284 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 SERPINA11Q86U17 422 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 NFKBIDQ8NI38 313 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 NCLNQ969V3 563 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 DGAT2Q96PD7 388 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 PKP2Q99959 881 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CNPPD1Q9BV87 410 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 DTX4Q9Y2E6 619 aa16.88■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 AKAP13Q12802 2813 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 B4E171 279 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CXCR6O00574 342 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 SLC34A2O95436 690 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 TNNI3P19429 210 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 GGT1P19440 569 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 S1PR1P21453 382 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 TSPAN7P41732 249 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 NKG7Q16617 165 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 SLC16A11Q8NCK7 471 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 OR1F2PQ96R84 312 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.87■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 FAM220BPB1ANY3 271 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 STK17BO94768 372 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 KRT75O95678 551 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CBX7O95931 251 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 MT-ND1P03886 318 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 PRIM2P49643 509 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 OCA2Q04671 838 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 MAPK11Q15759 364 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 SYPL1Q16563 259 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 VMACQ2NL98 169 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 OVCH1Q7RTY7 1134 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 OR2L13Q8N349 312 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 OR52R1Q8NGF1 315 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF597Q96LX8 424 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CNBD2Q96M20 576 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 PRDM9Q9NQV7 894 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 ERVK-19Q9WJR5 959 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 LOC400499M0QZD8 3231 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CRYBA2P53672 197 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CYP27C1Q4G0S4 372 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CPZQ66K79 652 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 VWA5B2Q8N398 1253 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 SLC9A6Q92581 669 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 C8orf44Q96CB5 159 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CTHRC1Q96CG8 243 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 OCEL1Q9H607 264 aa16.86■□□□□ 0.29
ATG4B-217ENST00000475693 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms