RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 REEP4Q9H6H4 257 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 IL1RL2Q9HB29 575 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 TMBIM4Q9HC24 238 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 SH2D2AQ9NP31 389 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 TAS2R9Q9NYW1 312 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 DTX4Q9Y2E6 619 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 RAP2CQ9Y3L5 183 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A087WV62 115 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A0G2JMM0 328 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1W2PPB8 328 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1W2PRS3 328 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM120BA0PK00 339 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 KIR3DP1A8MWS1 328 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PDPK1O15530 556 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 AKAP10O43572 662 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ITM2AO43736 263 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PEX11AO75192 247 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 COQ9O75208 318 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 LRATO95237 230 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 LDLRP01130 860 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 NAGAP17050 411 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 BGNP21810 368 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCD3P28288 659 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL3P39023 403 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PPICP45877 212 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC1A6P48664 564 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 DNASE1L1P49184 302 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 EMDP50402 254 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PPIAP62937 165 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PSPHP78330 225 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 DUSP8Q13202 625 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 STX3Q13277 289 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 NNATQ16517 81 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PRAMEF20Q5VT98 475 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM64Q6YI46 380 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 FJX1Q86VR8 437 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SPPL2CQ8IUH8 684 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFP28Q8NHY6 868 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 DIO2Q92813 273 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 TUBGCP3Q96CW5 907 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 MTERF3Q96E29 417 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 TTTY12Q9BZ98 90 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 GLIPR2Q9H4G4 154 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PINLYPA6NC86 204 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 FRG2CA6NGY1 282 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM166BA8MTA8 275 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 TBX19O60806 448 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PPM1BO75688 479 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP6AP2O75787 350 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 WISP2O76076 250 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PRPS2P11908 318 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 BCKDHAP12694 445 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 DRD5P21918 477 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SOX18P35713 384 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 HPCAL1P37235 193 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PIGAP37287 484 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 CA7P43166 264 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC18A1P54219 525 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXW4P57775 412 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PLCXD2Q0VAA5 305 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 C6orf136Q5SQH8 315 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PRR22Q8IZ63 422 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF781Q8N8C0 355 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 FNDC5Q8NAU1 212 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SIMC1Q8NDZ2 872 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 OR7G2Q8NG99 324 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 CLHC1Q8NHS4 586 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 RELTQ969Z4 430 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 TLCD1Q96CP7 247 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 C3orf30Q96M34 536 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 AMDHD1Q96NU7 426 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 BTBD9Q96Q07 612 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 DOHHQ9BU89 302 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SH3BP4Q9P0V3 963 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD33BA6NCL7 494 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PLOD2O00469 737 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PRRG2O14669 202 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms