RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 FAM57AQ8TBR7 257 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ZIM3Q96PE6 472 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 DOHHQ9BU89 302 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRA2Q9H9E1 313 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PROK2Q9HC23 129 aa22.04■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 MYO1GB0I1T2 1018 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ATP6AP2O75787 350 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TACR1P25103 407 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 DCAF7P61962 342 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 UGT3A2Q3SY77 523 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TBCELQ5QJ74 424 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 HSPBAP1Q96EW2 488 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 EGLN2Q96KS0 407 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ZFP64Q9NPA5 681 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 MEMO1Q9Y316 297 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 NINQ8N4C6 2090 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC13O75165 2243 aa22.03■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PIP5K1BO14986 540 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ACOX3O15254 700 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 JUNP05412 331 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 NAGAP17050 411 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 DRD5P21918 477 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 COL8A1P27658 744 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 NTSP30990 170 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PPICP45877 212 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 SERPINB4P48594 390 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 GALNTL6Q49A17 601 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 RPTNQ6XPR3 784 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 C3P1Q6ZMU1 363 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 MRGPRGQ86SM5 289 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CROCCP2Q86T23 111 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CD163Q86VB7 1156 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 PHF12Q96QT6 1004 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 CCT7Q99832 543 aa22.02■■□□□ 1.12
SMKR1-201ENST00000462322 MAST4O15021 2626 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD33BA6NCL7 494 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 LSM1O15116 133 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 PLOD3O60568 738 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 PPM1BO75688 479 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 CELA3AP09093 270 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 ARRB2P32121 409 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 PLCXD2Q0VAA5 305 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 SLC10A1Q14973 349 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM198Q66K66 360 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 BICRALQ6AI39 1079 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 EID3Q8N140 333 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 OR7G2Q8NG99 324 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 OMA1Q96E52 524 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 FCRL1Q96LA6 429 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 LIPGQ9Y5X9 500 aa22.01■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 CENPEQ02224 2701 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 WDR91A4D1P6 747 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 FRG2CA6NGY1 282 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC3CA6NJW4 275 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 NME6O75414 186 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 IGHG3P01860 377 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 RFPL3SP0C7P2 107 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 MYZAPP0CAP1 466 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 SDC1P18827 310 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 SMSP52788 366 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 ADORA2A-AS1P86434 159 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 TRILQ7L0X0 811 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF597Q96LX8 424 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 RILPQ96NA2 401 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 TSSK3Q96PN8 268 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 LDAHQ9H6V9 325 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 KCNK9Q9NPC2 374 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 B4GALT7Q9UBV7 327 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 UNC79Q9P2D8 2635 aa22■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 NPIPA2E9PIF3 369 aa21.99■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 E9PLN8 166 aa21.99■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 NPIPA3F8WFD2 350 aa21.99■■□□□ 1.11
SMKR1-201ENST00000462322 TM9SF1O15321 606 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms