RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438356.1

RBM33-208, Transcript of RNA binding motif protein 33, human

TSL 4

Gene RBM33, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM33-208	ENST00000438356	TACR1	P25103	407 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ARRB2	P32121	409 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	KRT20	P35900	424 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	MEOX1	P50221	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	CASP6	P55212	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PSPH	P78330	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	LTB4R	Q15722	352 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	SMU1	Q2TAY7	513 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	IL23R	Q5VWK5	629 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	GK5	Q6ZS86	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	LIX1	Q8N485	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	NATD1	Q8N6N6	113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	KAT2A	Q92830	837 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	MTERF3	Q96E29	417 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	FCRL1	Q96LA6	429 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	C1orf50	Q9BV19	199 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PRPS1L1	P21108	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PTGER1	P34995	402 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	GPR85	P60893	370 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	EMX2	Q04743	252 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	CEBPE	Q15744	281 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	CPTP	Q5TA50	214 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	MDGA2	Q7Z553	956 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	MAGED4	Q96JG8	741 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	EGLN2	Q96KS0	407 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	C3orf30	Q96M34	536 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	NUF2	Q9BZD4	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PNPO	Q9NVS9	261 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ITPR2	Q14571	2701 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356		A0A087WV62	115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	HDAC3	O15379	428 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PLOD3	O60568	738 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	TBX19	O60806	448 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	CBX7	O95931	251 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	FBXO45	P0C2W1	286 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	KIT	P10721	976 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PRF1	P14222	555 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	NAGA	P17050	411 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	LBP	P18428	481 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	S1PR1	P21453	382 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	CNR1	P21554	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	GPX3	P22352	226 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PPIC	P45877	212 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	KCNJ2	P63252	427 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	DUSP2	Q05923	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	MGAT2	Q10469	447 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	HSPB3	Q12988	150 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	RPS6KA2	Q15349	733 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63	4e-7	■■■□□ 17.3
RBM33-208	ENST00000438356	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	PAOX	Q6QHF9	649 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	TMEM107	Q6UX40	140 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM33-208	ENST00000438356	SZRD1	Q7Z422	152 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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