RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB40ALP0C0E4 278 aa4.17□□□□□ -1.74
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RPS3AP54-201ENST00000435535 IL1RNP18510 177 aa4.17□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGAM1P18669 254 aa4.17□□□□□ -1.74
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RPS3AP54-201ENST00000435535 CNTFP26441 200 aa4.17□□□□□ -1.74
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RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH1P12830 882 aa4.16□□□□□ -1.74
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RPS3AP54-201ENST00000435535 ELK3P41970 407 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
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RPS3AP54-201ENST00000435535 EFNA3P52797 238 aa4.16□□□□□ -1.74
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RPS3AP54-201ENST00000435535 OLR1P78380 273 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLC1Q07866 573 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC23BQ15437 767 aa4.16□□□□□ -1.74
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