RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN32Q9NX65 697 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 C5AR2Q9P296 337 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CCL26Q9Y258 94 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CKAP5Q14008 2032 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CCL16O15467 120 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 LRG1P02750 347 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PNLIPRP1P54315 467 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 C3orf38Q5JPI3 329 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 LSMEM1Q8N8F7 131 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PLA2G15Q8NCC3 412 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SORCS1Q8WY21 1168 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ATF6BQ99941 703 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 GLTPQ9NZD2 209 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CDH10Q9Y6N8 788 aa17.31■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ISM1B1AKI9 464 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 QSOX1O00391 747 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CASKO14936 926 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 NR2F6P10588 404 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP17.3■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 28
RALGPS1-208ENST00000424082 CCR2P41597 374 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 GAS1P54826 345 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ARSIQ5FYB1 569 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC5DQ6UXZ4 953 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP206Q8IYR0 622 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 UFD1Q92890 307 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 OMA1Q96E52 524 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR34Q96EX3 536 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 LRR1Q96L50 414 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00862A6NCI5 91 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SGK494L7N484 410 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 RTCAO00442 366 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3BP5O60239 455 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 RFPL3O75679 317 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC7A9P82251 487 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TAP2Q03519 686 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 RIN1Q13671 783 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC25A30Q5SVS4 291 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 KREMEN2Q8NCW0 462 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC5A11Q8WWX8 675 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 BADQ92934 168 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR137Q96N19 417 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SGPP1Q9BX95 441 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ITM2BQ9Y287 266 aa17.3■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ANHXE9PGG2 379 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 B4GALT2O60909 372 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TIMP2P16035 220 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 GABRA5P31644 462 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 INPP1P49441 399 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PER3P56645 1201 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPB3Q12988 150 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL22Q53GT1 634 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD54Q6NXT1 300 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TRILQ7L0X0 811 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 COMTD1Q86VU5 262 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CREB3L1Q96BA8 519 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 NEURL3Q96EH8 262 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ISYNA1Q9NPH2 558 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 DENND4CQ5VZ89 1909 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM129A0AVI4 362 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK2AP1O14519 115 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 FABP7O15540 132 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 NCR1O76036 304 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC22A5O76082 557 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CTSLP07711 333 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 AVPR1BP47901 424 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 MANFP55145 182 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 GINS1Q14691 196 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PLPP4Q5VZY2 271 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 NXPE4Q6UWF7 544 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 IQCF2Q8IXL9 164 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 FUZQ9BT04 418 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ACAT2Q9BWD1 397 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC46A2Q9BY10 475 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC28A3Q9HAS3 691 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 A4GALTQ9NPC4 353 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP50Q9UKX7 468 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ICKQ9UPZ9 632 aa17.29■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 OR5K3A6NET4 321 aa17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 NME6O75414 186 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
RALGPS1-208ENST00000424082 FGBP02675 491 aa17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms