RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WV48 116 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00862A6NCI5 91 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MX80 341 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX14O95416 240 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MECP2P51608 486 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT4P56705 351 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMK2DQ13557 499 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ADCK1Q86TW2 530 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GHDCQ8N2G8 530 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CADM2Q8N3J6 435 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4D9Q8NGE8 314 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB8BQ92930 207 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPM6Q9BX84 2022 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP20O60882 483 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MED26O95402 600 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF250P15622 560 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ARSBP15848 533 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TBRG1Q3YBR2 411 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ASPHD2Q6ICH7 369 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf40Q86WS4 652 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DTD2Q96FN9 168 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LRR1Q96L50 414 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 QRFPRQ96P65 431 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SAP130Q9H0E3 1048 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GLIPR2Q9H4G4 154 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R3H8 397 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TLR4O00206 839 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTA4O15217 222 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CRCPO75575 148 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TFP02787 698 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRNB1P11230 501 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRIM2P49643 509 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK-21P61565 698 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 COX10Q12887 443 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF77Q15935 545 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SPANXN2Q5MJ10 180 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GCNT6Q5T4J0 391 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf53Q5VUE5 145 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NXPE4Q6UWF7 544 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 P3H2Q8IVL5 708 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52N1Q8NH53 320 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AUTS2Q8WXX7 1259 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEAL4Q96EI5 215 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR14Q9BWN1 585 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DPEP2Q9H4A9 486 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NT5DC2Q9H857 520 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPV4Q9HBA0 871 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT9Q9HCQ5 603 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM29Q9UKF5 820 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MAFFQ9ULX9 164 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3.4□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SHANK1Q9Y566 2161 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ACP2P11117 423 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCL3P19876 107 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB37Q5TC79 503 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 THSD4Q6ZMP0 1018 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPRED2Q7Z698 418 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PLCZ1Q86YW0 608 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL6Q8N531 539 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ARRDC3Q96B67 414 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CLIP3Q96DZ5 547 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IL17FQ96PD4 163 aa3.4□□□□□ -1.87
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