RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 CHAC2Q8WUX2 184 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 FGF11Q92914 225 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 NUAK2Q9H093 628 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ABCB10Q9NRK6 738 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 NDUFB11Q9NX14 153 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R16Q9NYV7 291 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 CES1P1Q9UKY3 287 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 KLHL20Q9Y2M5 609 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 GPX5O75715 221 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 CEACAM5P06731 702 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SOX9P48436 509 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 KLHL22Q53GT1 634 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SLC48A1Q6P1K1 146 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 YAF2Q8IY57 180 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 MFSD9Q8NBP5 474 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 OR4K5Q8NGD3 323 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TSSK6Q9BXA6 273 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ISYNA1Q9NPH2 558 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 KLHL3Q9UH77 587 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ZNF229Q9UJW7 825 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ENTPD4Q9Y227 616 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 F5P12259 2224 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PR48 441 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SNTNA6NMZ2 147 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 EMC8O43402 210 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 CSO75390 466 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 MMP11P24347 488 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 MAN2A2P49641 1150 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SMSP52788 366 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 DEFA1P59665 94 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 DEFA3P59666 94 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TGM3Q08188 693 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SGCGQ13326 291 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 FGL2Q14314 439 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 KRT33BQ14525 404 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ZER1Q7Z7L7 766 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TCEANCQ8N8B7 351 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 OR2L3Q8NG85 312 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 OR52E1Q8NGJ3 308 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 OR5D16Q8NGK9 328 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SLC6A18Q96N87 628 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 STUB1Q9UNE7 303 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SNX7Q9UNH6 387 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 CKAP5Q14008 2032 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ERI3O43414 337 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TBX1O43435 398 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SOX14O95416 240 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SERPIND1P05546 499 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 CHRM4P08173 479 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 CMPK1P30085 196 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 MPIP34949 423 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SLC34A3Q8N130 599 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 UCN3Q969E3 161 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 WFDC6Q9BQY6 131 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ROGDIQ9GZN7 287 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 KLHL31Q9H511 634 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 RNF167Q9H6Y7 350 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa22.37■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ANTXRLA6NF34 631 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 EPPINO95925 133 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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PMS1-205ENST00000409985 C2orf27AQ580R0 203 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ZNF425Q6IV72 752 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 POC5Q8NA72 575 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 OR6T1Q8NGN1 323 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TXNDC15Q96J42 360 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ARHGDIGQ99819 225 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TMEM221A6NGB7 291 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SHISA7A6NL88 538 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 M0R3H8 397 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 RAB36O95755 333 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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